自由軟體(free software)與開放原始碼(open source)兩者雖然大體上宗旨相通，但在基本理念上卻稍有不同。

自由軟體與開放原始碼兩大運動都以「專屬封閉軟體」為共同敵人，不過老前輩級(1980年代初期)的自由軟體派認為沒有自由是一種社會問題，而誕生於1998年的開放原始碼派則認為「不自由」算是次等選擇。換言之，開放原始碼單純代表一種開發方法學，而自由軟體則有濃厚的社運味道。

開放原始碼與自由軟體兩大陣營各自喜好自己的名稱，雖然承認彼此的存在，但在名稱上盡量不互相混用，不過國內似乎沒有這種門戶之別，不論開放原始碼或自由軟體，兩個名稱都屬同一掛相互混用，比如官方的「自由軟體入口網站」英文則為Open Source Software Portal。
(陳奭璁)